※2015年3月 那覇=石垣線 運航休止
| 新石垣 ⇔ 那覇 | 新石垣 ⇔ 神戸 | 新石垣 ⇔ 成田 |
（※曜日や季節等によって運航していない路線がございます。）
| 便名 | 那覇発 | 新石垣着 | 便名 | 新石垣発 | 那覇着 |
| SKY 561 | 10：00 | 10：55 | SKY 560 | 09：00 | 09：55 |
| SKY 563 | 12：40 | 13：40 | SKY 562 | 11：35 | 12：30 |
| SKY 567 | 16：30 | 17：30 | SKY 564 | 15：20 | 16：15 |
| SKY 569 | 19：10 | 20：10 | SKY 566 | 18：10 | 19：05 |
（※ご利用予定のお客様におかれましては、最新の運航情報をご確認頂きますようお願い申し上げます。）
| バス | |||
| 都道府県 | 発着地 | 所要時間（目安） | 運賃 |
| 石垣 | 石垣港離島ターミナル | 35～50分 | 520円 |
| 石垣 | 平得 | 35分 | 460円 |
| 石垣 | 大浜 | 25分 | 380円 |
| タクシー | |||
| 石垣 | 石垣港離島ターミナル | 30分 | 2,700円 |
| 石垣 | 市街地 | 30分 | 2,500円 |
（※運賃は変更される場合がございます。所要時間・運賃は概算としてご利用ください。）
